ネットショップ運営代行おすすめ15選比較｜失敗しない選び方と費用相場を完全解説【2025年最新版】

ネットショップ運営に追われて本業に集中できない、専門知識不足で売上が伸び悩んでいる、といったお悩みを抱えていませんか？

2023年のEC市場規模は24.8兆円（経済産業省調べ）まで拡大し、競争が激化する中で、専門的なノウハウを持つプロに運営を任せる企業が急増しています。本記事では、2025年最新のネットショップ運営代行サービス15選を徹底比較し、あなたのビジネスに最適な代行会社の選び方から費用相場まで、成功するための全ての情報をお届けします。

ネットショップ運営代行とは？基本知識を押さえよう

ネットショップ運営代行とは、ECサイトの構築から商品登録、受注処理、顧客対応、マーケティングまで、ネットショップ運営に関わる業務全般を専門業者に委託するサービスです。

ネットショップ運営代行が注目される背景

EC市場の急成長に伴い、2020年度のEC・ネットショップ運営支援・代行サービス市場規模は前年比29.9%増の1,664億円（ミック経済研究所調べ）に達しました。コロナ禍によるデジタルシフトの加速や、専門スキルを持つ人材の不足により、運営代行サービスの需要は右肩上がりで増加しています。

多くの企業が直面する課題として、「EC運営の専門知識不足」「人手不足」「売上拡大のためのノウハウ不足」が挙げられます。これらの課題を解決し、効率的で収益性の高いネットショップ運営を実現するのが、運営代行サービスの役割です。

ネットショップ運営代行のサービス範囲

運営代行サービスでは、以下のような幅広い業務を委託できます。

フロントエンド業務

ECサイト構築・デザイン
商品撮影・登録（ささげ業務）
マーケティング・集客施策
SEO対策・広告運用

バックエンド業務

受注処理・在庫管理
発送・物流管理
顧客対応・カスタマーサポート
データ分析・レポート作成

ネットショップ運営代行の選び方｜5つの重要ポイント

ネットショップ運営代行を成功させるためには、自社のニーズに合ったサービスを選ぶことが重要です。

1. プラットフォームとの適合性を確認する

ネットショップの運営方法は、ECモールと自社ECで大きく異なります。

ECモール型の特徴

楽天市場・Amazon・Yahoo!ショッピングなど
集客力が高い反面、手数料が発生
プラットフォーム独自のルールやガイドラインが存在

自社EC型の特徴

Shopify・MakeShop・EC-CUBEなど
カスタマイズ性が高く、ブランディングしやすい
集客は自社で行う必要がある

代行業者によってそれぞれの得意分野が異なるため、自社が利用するプラットフォームに精通した業者を選ぶことが重要です。

2. 委託したい業務範囲を明確にする

ネットショップ運営代行は、委託する業務範囲によって大きく3つのタイプに分類されます。

完全委託型

サイト構築から物流まで全工程を委託
手間を大幅に削減できるが、コストは高額
ノウハウが社内に蓄積されにくい

部分委託型

特定の業務のみを委託
コストを抑えながら必要な部分だけサポート
社内体制との使い分けが可能

コンサルティング型

戦略立案や改善提案が中心
実作業は自社で行う
ノウハウを学びながら内製化を目指せる

3. 業界・商材の専門性を評価する

代行業者の中には、特定の業界や商材に特化した専門性を持つ会社があります。

業界特化の例

美容・健康系：規制対応や訴求方法に精通
食品系：賞味期限管理や温度管理に対応
アパレル系：サイズ展開や季節性を理解
BtoB系：法人向けの受発注フローに対応

自社の商材に近い実績を持つ業者を選ぶことで、より効果的な運営が期待できます。

4. 料金体系とコストパフォーマンスを比較する

ネットショップ運営代行の料金体系は主に3つのパターンがあります。

月額固定型

毎月一定の料金を支払う
予算管理がしやすい
売上に関係なく費用が発生

成果報酬型

売上の一定割合を支払う
成果が出ない場合は費用を抑えられる
売上が伸びると費用も増加

複合型（固定費＋成果報酬）

固定費と成果報酬の組み合わせ
バランスの取れた料金体系
最も一般的なパターン

5. 将来的な内製化の可否を検討する

ネットショップ運営代行を利用する際は、将来的な方向性も考慮する必要があります。

完全委託を継続する場合

長期的なパートナーシップが重要
サービスの安定性や継続性を重視
費用対効果の持続性を確認

段階的な内製化を目指す場合

ノウハウ移転に積極的な業者を選択
教育・研修プログラムの有無を確認
段階的な業務移管に対応できるか確認

ネットショップ運営代行の費用相場と料金体系

ネットショップ運営代行の費用は、委託する業務範囲や料金体系によって大きく異なります。以下は複数社のデータから算出した参考相場です。

料金体系別の費用相場

料金タイプ	費用相場	特徴・メリット	デメリット
成果報酬型	売上の5～20%程度	・成果が出ない場合は費用を抑えられる・運営代行会社のモチベーションが高い	・売上が増加すると費用も増加・短期的な売上重視になりがち
月額固定型	月額1～30万円程度	・予算計画を立てやすい・売上に関係なく一定のサービスを受けられる	・成果が出ていなくても費用が発生・売上規模に関係なく固定費
複合型	固定費1～10万円＋売上の5～10%程度	・成果報酬型と固定型の良い点を組み合わせ・最も一般的な料金体系	・両方の費用が発生するため高額になる可能性

※上記は2025年6月時点の調査による参考相場であり、実際の料金は各社の業務内容・契約条件により変動します。

業務範囲別の費用目安

完全委託（フルサポート）

費用相場：月額20～50万円＋売上の5～10%程度
含まれる業務：サイト構築、商品登録、受注処理、発送、顧客対応、マーケティング
適用ケース：人手不足の解消、専門知識の活用

部分委託

費用相場：月額5～20万円＋売上の10～15%程度
含まれる業務：特定業務（商品登録、受注処理、マーケティングなど）
適用ケース：特定業務の効率化、専門性の補完

コンサルティング

費用相場：月額5～15万円＋売上の5%程度
含まれる業務：戦略立案、改善提案、分析レポート
適用ケース：ノウハウ習得、内製化準備

追加費用・オプション料金

基本料金以外に発生する可能性がある費用も確認しておきましょう。

初期費用

サイト構築費：10～100万円
システム連携費：5～20万円
初期設定費：3～10万円

オプション費用

商品撮影：1商品1,000～5,000円
広告運用：広告費の10～20%
システム開発：別途見積もり

ネットショップ運営代行のメリット・デメリット

ネットショップ運営代行を利用するメリット

専門知識とノウハウの活用

ネットショップ運営代行最大のメリットは、EC運営の専門知識とノウハウを活用できることです。

マーケティングの専門性

SEO対策やリスティング広告の効果的な運用
SNS活用やインフルエンサーマーケティング
データ分析に基づく改善施策の提案

運営効率化のノウハウ

業務フローの最適化
システム活用による自動化
在庫管理や物流の効率化

業務負荷の大幅軽減

ネットショップ運営には多岐にわたる業務が発生しますが、代行サービスの活用により、これらの負荷を大幅に軽減できます。

日常的な運営業務

商品登録・更新作業
受注処理・在庫管理
顧客対応・問い合わせ対応

専門的な業務

商品撮影・画像編集
サイトデザイン・コーディング
広告運用・効果測定

売上向上の期待

プロフェッショナルによる運営により、売上向上も期待できます。

コンバージョン率の改善

ユーザビリティを考慮したサイト設計
魅力的な商品ページの作成
効果的な導線設計

集客力の強化

検索エンジン最適化（SEO）
効果的な広告運用
SNSマーケティングの活用

ネットショップ運営代行のデメリットと注意点

コストの発生

外部委託には当然コストが発生するため、費用対効果を慎重に検討する必要があります。

固定コストの増加

売上に関係なく発生する月額費用
長期契約による固定費の負担
初期費用の投資回収期間

成果報酬による利益圧迫

売上増加に伴う代行費用の増加
利益率への影響
長期的な収益性の検討

社内ノウハウの蓄積不足

完全委託の場合、社内にEC運営のノウハウが蓄積されないリスクがあります。

依存関係の発生

代行会社に依存した運営体制
内製化の困難さ
将来的な選択肢の制限

スキル習得機会の減少

社員のスキルアップ機会の減少
EC運営能力の社内育成不足
業界トレンドへの感度低下

情報共有とコミュニケーションの課題

外部委託により、情報共有やコミュニケーションに課題が生じる場合があります。

意思決定スピードの低下

社内外での意思決定プロセスの複雑化
迅速な対応の困難さ
緊急時の対応遅れ

ブランドイメージの統制

ブランド価値観の共有不足
顧客対応品質のばらつき
マーケティングメッセージの一貫性

2025年のネットショップ運営代行トレンド

2025年のネットショップ運営代行業界では、以下のようなトレンドが注目されています。

AI・自動化技術の活用拡大

AIを活用したパーソナライゼーション

顧客行動分析に基づく商品レコメンド
チャットボットによる24時間顧客対応
動的価格設定の自動化

業務自動化の進展

在庫管理の自動化
受注処理の効率化
レポート作成の自動化

動画コンテンツの重要性増大

動画マーケティングの本格化

商品紹介動画の制作代行
ライブコマースの運営支援
SNS動画広告の運用

越境ECへの対応強化

グローバル展開支援

多言語サイト構築
海外物流・決済対応
現地マーケティング支援

データドリブン運営の浸透

高度な分析・改善提案

顧客生涯価値（LTV）の最適化
詳細な競合分析
予測分析に基づく在庫最適化

まとめ｜成功するネットショップ運営代行の活用法

ネットショップ運営代行は、EC事業の成長を加速させる強力なツールです。しかし、その効果を最大化するためには、適切な業者選択と明確な目標設定が不可欠です。

成功のための重要ポイント

自社の現状と課題を正確に把握する
委託する業務範囲と期待する成果を明確にする
複数の代行会社から相見積もりを取る
実績と専門性を重視して業者を選定する
定期的な効果測定と改善を継続する

2025年のEC市場では、さらなる競争激化が予想されます。プロフェッショナルな運営代行サービスを活用し、効率的で収益性の高いネットショップ運営を実現することで、この競争を勝ち抜いていきましょう。

適切な運営代行パートナーとの出会いが、あなたのEC事業を次のステージへ押し上げる鍵となります。本記事で紹介したポイントを参考に、最適な運営代行サービスを見つけて、ネットショップ事業の成功を掴んでください。

注意事項：本記事に記載された料金・サービス内容は2025年6月時点の情報です。最新の詳細な料金やサービス内容については、各社に直接お問い合わせください。

ネットショップ運営代行とは？基本知識を押さえよう

ネットショップ運営代行が注目される背景

ネットショップ運営代行のサービス範囲

おすすめのネットショップ運営代行サービス15選徹底比較

総合型運営代行サービス（物流まで完全対応）

1. アートトレーディング株式会社

2. サヴァリ株式会社

3. GMOメイクショップ株式会社（EC運営代行 by GMO）

運用支援特化型サービス

4. 株式会社いつも

5. 株式会社飛躍（グロースハックサポート）

6. 株式会社idiom

特化型・スポット利用サービス

7. 株式会社ネクストエンジン（NE株式会社）

8. 株式会社Proteinum

9. 株式会社スタイリスト

10. ECレスキュー（株式会社ロジスティクスウェーブジャパン）

11. 株式会社アプロ総研

12. 株式会社YUGETA ECコンサルティング

13. 株式会社ワンプルーフ

14. 商品登録代行ドットコム（株式会社ラスホート）

15. arounds（株式会社arounds）